在进行液相色谱仪分析实验时，流动相再进入仪器之前，必须使用超声波清洗机进行简单的除气泡处理，以防对泵造成损害，对检测结果造成干扰。若在检测过程中发现液相色谱仪恒流泵里有气泡，须及时进行排除，排除高压液相色谱仪泵中气泡的方法如下。
（1）首先，检查流动相储液瓶中的溶剂过滤头是否阻塞。具体做法：将输入三通器上的溶剂塑料连接管的卸下，将流动相储液瓶置于高位，利用压差使溶液流出。如果溶剂流的很顺畅，说明溶剂过滤头是好的。如果是一滴一滴的流出，则说明过滤头阻塞，需要超声清洗，复原。
（2）用堵头将仪器的高压液流输出口封住（将色谱柱连在管路上），可避免在抽液时将空气抽入管路内。将仪器所配的注射器及塑料连接管插到放空阀的导管上，逆时针旋开放空阀旋钮，抽液5-10mL，将泵的流速设定在每分钟一毫升的流速。启动泵，观察塑料连接管的流动溶液是否还有气泡。如没有气泡说明从过滤头到放空阀这一段已将气泡排除。
（3）将泵关闭，将堵头从仪器的高压液流输出口去掉（将色谱柱从管路上卸掉）使输出口放空。顺时针关闭放空阀旋钮，将泵的流速设定在3-5mL的流速，将泵内的阻尼器和压力传感器的气泡赶出，流出溶液10-15mL将泵关闭。连接上色谱柱，将流速设定在每分钟一毫升，启动泵，观察压力及压力脉动。
（4）用水和异丙醇（甲醇）交替冲洗泵的内腔，使吸附在内墙壁上的气泡赶出。
（5）应用快速降压法赶出气泡：用小堵头将泵的流动相输出口堵上，将流速设定在1毫升/分，将柱前压力升至20Mpa左右，将排空阀快速打开，重复2~3即可。
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